lipids.ru

Блог Ивана Болдырева

PAPAPG — мембранный темный тушитель для пиреновых зондов

Для широко распространненных флуоресцентных липидных зондов на основе пирена мы сделали темный (не излучающий) тушитель флуоресценции. Это диазокраситель с глицериновой полярной головкой.

Читать полностью.


Новый липидный зонд — BCHB-PC

В пару к нашему зонду TMB-PC мы сделали акцептор — новый зонд BCHB-PC. Красота этой работы в том, что зонды обладая очень близкой структурой (имея одинаковые системы сопряжения и не отличаясь полярными группами), тем не менее различаются по спектральным характеристикам. При чем BCHB-PC является хорошим акцептором для TMB-PC.

Читать полностью.


Инструкция по анализу фосфатидилхолинов

Сделал инструкцию по анализу спектров фосфатидилхолина. Приведено отнесение всех протонов. Описано, как определить чистоту фосфатидилхолина и его жирнокислотный состав. Инструкция подходит для обезжиренных лецитинов разной степени очистки.

Перейти к инструкции.


Калькулятор радиуса Фёрстера

Вместе с Павлом Волынским мы разработали приложение для расчета радиуса Фёрстера. Если заметите ошибки в работе приложения, пожалуйста, напишите мне. Мы постараемся поправить.

Причина по которой мы взялись за это приложение простая. Формулы для расчета радиуса Фёрстера очень громоздкие и включают интегралы спектров поглощения и испускания. Эта громоздкость приводит к тому, что использование метода FRET неспециалистами неоправданно (на мой взгляд) усложняется. Приложение написано чтобы понизить барьер использования FRET неспециалистами и так способствовать использованию собственных зондов.

Для использования приложения нужно загрузить в него файлы спектров (в текстовом виде) и указать квантовый выход и коэффициент экстинкции. Приложение рассчитает радиус Фёрстера и интеграл перекрывания, построит нормированные спектры и отдельно область перекрывания.

Запустить приложение «Калькулятор радиуса Фёрстера».